Categories

Entrada publicada a:

dilluns, 27 de gener de 2014

Susana Kalko explica la importància de la Bioinformàtica en un Seminari de les Plataformes IDIBAPS

La Dra. Susana Kalko va protagonitzar el 15 de gener un Seminari de les Plataformes IDIBAPS en què va explicar els serveis que ofereix la Plataforma de Bioinformàtica, així com els reptes que afronta. Aquesta Plataforma es dedica principalment a l’anàlisi i suport en la interpretació de les dades procedents de diferents disciplines “òmiques” , com ara genòmica, transcriptòmica, proteòmica i metabolòmica. Amb una llarga experiència, aquesta Plataforma és un suport important per a nombrosos projectes de recerca.

La comprensió de la biologia de les malalties ha avançat enormement des de la profusa aplicació d’aquestes disciplines en l’era post-genòmica. És àmpliament reconegut que el funcionament real d’un sistema es pot explicar per l’activitat de tots els seus components juntament amb les seves interrelacions, i la seva relació amb l’entorn, i no simplement per la suma dels gens, proteïnes o metabòlits. La integració de les dades procedents d’aquests camps requereix grans esforços en el desenvolupament dels llenguatges comuns, eines, i bases de dades específiques i globals. Per a la integració de dades “òmiques” és necessària una nova concepció de científics (o equips de científics) amb un coneixement pràctic dels diferents enfocaments post-genòmics, la fisiopatologia de la malaltia i de la modelització bioinformàtica.

La plataforma que lidera la Dra. Susana Kalko porta molts anys acumulant experiència en estudis d’expressió diferencial en totes les disciplines “òmiques” (encara que la majoria són de transcriptòmica – microarrays), i moltes publicacions així ho reflecteixen. Aquests estudis solen tenir dos grans reptes: l’alta dimensionalitat, i normalment la petita grandària de la mostra, pel que és imprescindible disposar d’eines sofisticades amb metodologies estadístiques molt complexes per extreure’n informació i coneixement.

Una de les principals necessitats actuals de la Plataforma de Bioinformàtica és la combinació de dades complexes “òmiques” en el marc de la biologia de sistemes. Utilitzen per a això una gran quantitat d’eines, basades principalment en principis d’interaccions físiques o funcionals, i deriven xarxes (networks) biològiques que proveeixen un major coneixement dels processos funcionals bàsics associats a les patologies (especialment important en el cas de malalties complexes com la diabetis, la MPOC o les coronàries). Es generen així noves vies d’exploració i noves perspectives en els projectes d’investigació.

Comparteix aquesta entrada

  • del.icio.us
  • Facebook
  • Google
  • E-mail this story to a friend!
  • LinkedIn
  • Technorati
  • TwitThis
  • Meneame
  • StumbleUpon

Etiquetes

Els comentaris estan tancats.